Het plan van de gemeente Amsterdam om 70.000 woningen te bouwen in en om de haven staat op gespannen voet met de belangen van de haven en de bedrijven daar, vooral in de periode van transformatie. Het havenbedrijf heeft daarom afwijzend gereageerd op het plan Haven-Stad. Het Havenbedrijf vindt dat het plan onvoldoende rekening houdt met de belangen van de haven en de bedrijven in het gebied. Bovendien zou het leefklimaat voor toekomstige bewoners onvoldoende verzekerd zijn. De inspraakperiode eindigde 15 augustus.
Het plan Haven-Stad voorziet in de bouw van een nieuw stadswijk in het westelijk havengebied, met een uitloper aan de noordzijde van het IJ. Onder de naam Haven-Stad wil Amsterdam in dat gebied een wijk bouwen ter grootte van Leiden. Het deel van het havengebied binnen de ring (A10) moet circa 25.000 woningen accommoderen. De transformatie naar ‘hoogstedelijk gemengd gebied’ heeft volgens het Havenbedrijf grote gevolgen voor de bedrijven die er zijn gevestigd.
De transformatie van haven naar woonwijken zou moeten plaatsvinden in de huidige Minervahaven (nu vooral fashion- en mediabedrijven); de Alfadriehoek (nu stedelijke bedrijvigheid en kantoren), de Coen-, Vlot- en Mercuriushaven (nu een industrieel gebied met grote internationale bedrijven). Het Havenbedrijf voorziet grote problemen voor bedrijven in het toekomstige woon/werkgebied. De milieu-eisen die voor woonwijken gelden zorgen voor forse beperkingen. Daarbij komt de bereikbaarheid en de verkeersveiligheid zowel tijdens de bouw als na afronding onder druk te staan. Daarbij maken de plannenmakers volgens het Havenbedrijf niet duidelijk welke financiële compensatie de huidige gebruikers krijgen en hoe dat gefinancierd gaat worden. Dat zorgt voor langdurige onrust bij de huidige ondernemingen in het gebied.
Het Havenbedrijf wijst op het huidige convenant van havenbedrijven met gemeente en provincie. Daarin is afgesproken dat er niet eerder dan in 2029 wordt gestart met woningbouw in het gebied. Daarnaast is in het huidige coalitieakkoord afgesproken dat de industriële bedrijven in de Coen- en Vlothaven – óók gelegen binnen de ring – in ieder geval kunnen blijven tot 2040. Maar het actuele plan beperkt al ruimschoots vóór 2040 de milieuruimte van deze bedrijven en zal hun bereikbaarheid nadelig beïnvloeden. Dat verslechtert de verdiencapaciteit van de haven en de investeringsbereidheid van bedrijven in het gebied, aldus het Havenbedrijf Amsterdam.